Side Questscourse¶

Resum del curs

Traducció assistida per IA - més informació i suggeriments

Les Side Quests són mini-cursos de formació independents que aprofundeixen en temes específics de Nextflow.

Cada side quest es pot fer de manera independent, en qualsevol ordre, segons els vostres interessos i necessitats.
Informació addicional

Requisits tècnics

Necessitareu un compte de GitHub O una instal·lació local de Nextflow. Consulteu Opcions d'entorn per a més detalls.
Objectius d'aprenentatge
- Configurar un entorn de desenvolupament de Nextflow productiu
- Aplicar patrons avançats de programació per a transformacions de dades complexes
- Gestionar i propagar metadades a través de workflows de múltiples passos
- Dividir i agrupar canals de dades per al processament paral·lel i en sèrie
- Provar workflows de Nextflow amb nf-test
- Composar pipelines complexos a partir de mòduls de workflow reutilitzables amb nom
- Treballar eficientment amb fitxers mitjançant les operacions de fitxers de Nextflow
- Depurar problemes comuns de workflows de manera sistemàtica
- Utilitzar i crear plugins de Nextflow
Públic i prerequisits
- Públic: Aquesta col·lecció està dissenyada per a persones que han completat el curs per a principiants Hello Nextflow i volen aprofundir en temes específics.
- Habilitats: S'assumeix experiència amb la línia de comandes i familiaritat amb els conceptes i eines bàsics de Nextflow.
- Cursos: Cal haver completat Hello Nextflow o equivalent.

Visió general del curs¶

Si és la primera vegada que exploreu les Side Quests, comenceu per la pàgina d'Orientació per obtenir una visió general de l'entorn de formació i els materials.

Side Quests¶

Side Quest	Resum	Temps Estimat
Entorn de Desenvolupament	Configurar un entorn de desenvolupament local de Nextflow productiu	45 minuts
Patrons Essencials de Programació	Tècniques avançades de programació per a reptes habituals en workflows	90 minuts
Processament de Fitxers d'Entrada	Gestió de fitxers, operacions de rutes i organització de sortides	45 minuts
Metadades i Meta Maps	Ús de mapes de metadades per fer el seguiment i propagar informació de mostres	45 minuts
Divisió i Agrupació	Tècniques per dividir i reagrupar canals de dades	45 minuts
Proves amb nf-test	Escriure i executar proves per a workflows de Nextflow	1 hora
Depuració de Workflows	Identificar i corregir errors habituals en workflows	1 hora
Workflows de Workflows	Composar pipelines complexos a partir de mòduls de workflow reutilitzables amb nom	30 minuts
Desenvolupament de Plugins	Utilitzar i crear plugins de Nextflow	3 hores

Comenceu

Feu-nos saber quins altres temes us agradaria veure coberts aquí publicant a la secció de Formació del fòrum de la comunitat.